Meslek hayatı boyunca hem askeri hem de sivil birçok önemli kurumda görev yapmıştır.Kariyerine GATA Haydarpaşa Eğitim ve Araştırma Hastanesi’nde başlayan Prof. Dr. Başak, Ardahan Asker Hastanesi, İstanbul Memorial Hastanesi, Türkiye Hastanesi, Ümraniye EAH gibi çeşitli kurumlarda görev almış, aynı zamanda akademik kariyerine de devam etmiştir. Prof. Dr. Başak’ın 151 adet Bilimsel Yayını ve “Eksternal Gastrik Balon (Tokluk Balonu)” isimli Obezitede yeni bir tedavi yöntemine ait “Patent”i vardır.2011-2016 yılları arasında Yalova Üniversitesi'nde görev yapan Prof. Dr. Başak, 2021 yılından bu yana Üsküdar Üniversitesi İç Hastalıkları Anabilim Dalı Başkanlığı görevini hala sürdürmektedir. 2025 yılı itibari ile İstanbul Şişli de kendi muayehanesinde hizmet vermeye devam etmektedir.
Prof. Dr. Mesut Başak şu anki kayıtlarımıza göre Prof. Dr. Mesut Başak Muayenehanesi kurumunda görev almaktadır. Randevu için Prof. Dr. Mesut Başak Muayenehanesi kurumunu arayabilir, MHRS Randevu adresini kullanabilir veya ALO 182 üzerinden Mesut Başak için randevu oluşturabilirsiniz.